SinoMed系统中“中国生物医学文献数据库”和“西文生物医学文献数据库”对检索结果进行了详细分类。“中国生物医学文献数据库”对检索结果从三方面进行了分类，分别为核心期刊、中华医学会期刊、循证文献。
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核心期刊指被《中文核心期刊要目总览》或者《中国科技期刊引证报告》收录的期刊、）中华医学会期刊是由中华医学会编辑出版的医学期刊、循证文献文献指SinoMed系统对检索结果进行循证医学方面的策略限定所得结果。
“西文生物医学文献数据库”对检索结果从五方面进行了分类，分别为免费全文、协和馆藏、SCI收录、F1000、循证文献。
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免费全文是被网络生物医学免费期刊出版发行的西文全文文献、协和馆藏是被北京协和医学院图书馆收录的西文文献、SCI收录是指被最新版《科学引文索引》(Science Citation Index, SCI)收录的文献、F1000则是被Faculty of 1000 Medicine和Faculty of 1000 Biology收录的文献。